里昂第一大学共设有5个教学研究单位(faculté)，3个学院(Institut)，5个学校(école)以及一个独立的系，分别为：里昂东部医学院；里昂南部梅里约医学院；牙科学院；科学与技术学院；体育科学与技术学院(UFR STAPS)；医药学及生物学院(ISPB)；复建科学与技术学院(ISTR)；里昂一大大学技术学院；里昂一大大学理工学校；金融学及保险学校；里昂科学院硕士培养学校(IUFM)；里昂天文台；化学、物理、电子高等学院；人体生物学系(BH)